Početak organizovane prevencije počinje u Subotici 1907. godine, radom privatne hemijske laboratorije, koja je privremeno davala usluge i zdravstvenoj službi. U jednom izveštaju iz 1910. godine spominje se osnivanje bakteriološke laboratorije ali je Gradska uprava tek septembra 1911. godine predložila da se usvoji i izvrši uređivanje i opremanje prostorija koje su predviđene za laboratoriju. Prostorije su na III spratu Gradske kuće: to su četiri prostrane, svetle sobe sa dobrim osvetljenjem, parnim i plinskim grejanjem; radna soba fizikusa je ujedno i bakteriološka laboratorija, a ostale prostorije zauzima hemijska laboratorija. Iako su laboratorije ranije davale usluge (naročito hemijska) zvanično je Laboratorija počela sa radom tokom 1912. godine. Iste godine doneta je Odluka o formiranju Centralnog dezinfekcionog instituta. Osnivanjem ovih laboratorija i ustanove za dezinfekciju se poboljšava kontrola i lečenje bolesnika sa zaraznim bolestima, pa je tako i sprečena veća epidemija trbušnog tifusa u Subotici tokom 1913/14. godine. Na ovaj način Subotica je postala jedan od retkih provincijskih gradova tadašnje Austrougarske države koji je u to vreme imao laboratorije i koje su, zapravo, temelji današnjeg Zavoda za javno zdravlje.
Pravilnikom NR Srbije iz 1957. godine reguliše se osnivanje, organizacija i rad Higijenskih zavoda. Tako i Sanitarno-epidemiološka stanica u Subotici dobija naziv "Higijenski zavod" decembra 1958. godine (rešenje Nar. Odbora Subotice br. 909-22054/58). Ustanova je sa samostalnim finansiranjem. Zavod je smešten i dalje na III spratu Gradske kuće i njime rukovodi A. Liht od 1951. do 1972. godine. Zbog povećanog obima rada podiže se posebna zgrada i Zavod se preseljava 1962. godine u prostrane i funkcionalne prostorije novoizgrađenog objekta, gde se i danas nalazi.
Iste godine Zavod dobija novi naziv – Zavod za zdravstvenu zaštitu. Nove prostorije i nova opremljenost omogućavaju da se u Zavodu formiraju: Odeljenje za bakteriologiju, Hemijsko odeljenje, Dispanzer za medicinu rada, Odeljenje za epidemiologiju, Odeljenje školske higijene, Odeljenje zdravstvenog prosvećivanja, Antitrahomno odeljenje i Odeljenje za administraciju. (https://zjzs.org.rs)